R语言来自S语言，是S语言的一个变种。S语言由Rick Becker, John Chambers等人在贝尔实验室开发， 著名的C语言、Unix系统也是贝尔实验室开发的。
S语言第一个版本开发于1976-1980，基于Fortran； 于1980年移植到Unix, 并对外发布源代码。 1984年出版的“棕皮书” (Becker and Chambers 1984) 总结了1984年为止的版本, 并开始发布授权的源代码。 这个版本叫做旧S。与我们现在用的S语言有较大差别。
1989–1988对S进行了较大更新， 变成了我们现在使用的S语言，称为第二版。 1988年出版的“蓝皮书” (Becker, Chambers, and Wilks 1988) 做了总结。
1992年出版的“白皮书” (Chambers and Hastie 1992) 描述了在S语言中实现的统计建模功能， 增强了面向对象的特性。软件称为第三版，这是我们现在用的多数版本。
1998年出版的“绿皮书” (Chambers 2008) 描述了第四版S语言，主要是编程功能的深层次改进。 现行的S系统并没有都采用第四版，S-PLUS的第5版才采用了S语言第四版。
S语言商业版本为S-PLUS, 1988年发布，现在为Tibco Software拥有。 命运多舛，多次易主。
R是一个自由软件，GPL授权， 最初由新西兰Auckland 大学的Ross Ihaka 和 Robert Gentleman于1997年发布， R实现了与S语言基本相同的功能和统计功能。 现在由R核心团队开发，但全世界的用户都可以贡献软件包。
R的网站: http://www.r-project.org/
