许多网站提供数据供其用户使用。 例如,世界卫生组织(WHO)以CSV,txt和XML文件的形式提供健康和医疗信息的报告。 使用R语言程序,我们可以从这些网站以编程方式提取特定数据。 R语言中用于从网站中提取数据的一些包是“RCurl”,XML“和”stringr“,它们用于连接到URL,识别文件所需的链接并将它们下载到本地环境。
安装R语言的包
处理URL和链接到文件需要以下的包。 如果它们在R语言环境中不可用,您可以使用以下命令安装它们。
install.packages("RCurl") install.packages("XML") install.packages("stringr") install.packages("plyr")
输入数据
我们将访问URL天气数据,并使用R在2015年下载CSV文件。
例
我们将使用函数getHTMLLinks()来收集文件的URL。 然后我们将使用函数downlaod.file()将文件保存到本地系统。 由于我们将对多个文件一次又一次地应用相同的代码,因此我们将创建一个被多次调用的函数。 文件名作为参数以R列表对象的形式传递到此函数。
# Read the URL. url <- "http://www.geos.ed.ac.uk/~weather/jcmb_ws/" # Gather the html links present in the webpage. links <- getHTMLLinks(url) # Identify only the links which point to the JCMB 2015 files. filenames <- links[str_detect(links, "JCMB_2015")] # Store the file names as a list. filenames_list <- as.list(filenames) # Create a function to download the files by passing the URL and filename list. downloadcsv <- function (mainurl,filename) { filedetails <- str_c(mainurl,filename) download.file(filedetails,filename) } # Now apply the l_ply function and save the files into the current R working directory. l_ply(filenames,downloadcsv,mainurl = "http://www.geos.ed.ac.uk/~weather/jcmb_ws/")
验证文件下载
运行上述代码后,您可以在当前R语言工作目录中找到以下文件。
"JCMB_2015.csv" "JCMB_2015_Apr.csv" "JCMB_2015_Feb.csv" "JCMB_2015_Jan.csv" "JCMB_2015_Mar.csv"